說到南部體育勁旅絕對不會忽略高苑工商，高苑棒球隊在棒壇贏得「綠色怪物」的美名，籃球隊沉寂多年後在田本玉教練的帶領下，近年化身南部猛牛部隊，是近年在HBL行列中來自南部的強隊。
高苑青棒隊在1972年組成，後因球員來源問題在1977年淡出棒壇，直到1993時有當年的高雄縣長余政憲(現高苑工商董事長)組織重啟青棒隊，在短時間內崛起，至今都是國內青棒頂尖球隊。
高苑棒球隊出了許多旅外好手，其中包括台灣棒球史上第一位以投手身份出現在美國大聯盟的曹錦輝，此外旅美好手還有陳偉殷、陳鏞基等等，更有許多校友投入國內職棒。
轉到籃球隊，自87學年度成軍，2014年原是台南新榮中學籃球隊的教練田本玉「田媽」，在余政憲董事長三顧茅廬下最終答應到高苑接下女教頭一職，隨即帶領綠色猛牛擠進12強，來勢洶洶成為近年南部唯一晉級複賽的隊伍，更在104、105學年度首度闖進小巨蛋的高中籃球四強舞台。
高苑除了棒籃出色外，在去年也成立足球隊，由於余政憲過去擔任過中華男足領隊，因緣際會之下朋友主動號召而正式成軍足球隊，高苑工商體育組林丁陸組長說明，校內正好有遠從越南、印尼、馬來西亞來的僑生，這些學生很喜歡踢足球，也代表學校參加五人制中等學校足球聯賽，因為團隊是建教合作的關係，訓練時間有限，但熱情足以為學校的運動氛圍又注入一股新活水。
高苑校方全力投入運動產業，讓來就讀的體保生都以公費就學，不過養球隊花費相當高，加上少子化學校經費有限，余政憲董事長積極幫球隊募款，持續讓這間傳統體育名校能夠稱霸南台灣。
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